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实验室开放课题和访问学者情况统计

  • 关键字: 实验室开放课题和访问学者情况统计 发布者:宣传部 发布时间:2009-02-25 09:02:13 点击数: 4657次

1. 设置开放课题和访问学者情况,以及开放课题所取得的重要成果等

本室一直积极开展开放课题和合作课题的研究,并取得了一系列重要的成果。在重点实验室专项经费落实之前,以开展与学科交叉的著名实验室的合作课题为主,实验人员频繁互访,并充分利用双方的实验设备和条件开展交叉课题的研究。取得的重要进展包括:与裴刚院士在趋化因子受体拮抗剂课题的合作,已申请两项国际专利,并完成了一个活性分子治疗爱滋病药物的一期临床实验;与饶子和院士在冠状病毒蛋白水解酶抑制剂课题的合作,发现了具有广谱抑制活性的化合物,论文发表于PLoS Biology;与美国麻省总医院Szostak教授在非天然核酸TNA课题的研究,结果发表于J. Am. Soc. Chem. 等等。在开放课题方面,资助了邓子新院士、杨震、周翔、秦勇、翟宏斌、黄培强等杰出青年基金获得者的课题,同时也资助了一些年青学者的课题,见下表。这些开放课题和合作课题的研究结果已发表高水平论文32篇。 

除了和“海外知名学者创新团队”海外成员的合作外,本室研究人员也积极与国内外本领域具有影响的科学家建立稳定的工作联系,与他们开展合作研究,积极促进我们在化学生物学研究领域的发展。下表是一些有代表性的国内外合作研究的例子。

 
序号
合作课题
合作者及单位
发表文章或研究内容
1
基于趋化因子受体的小分子药物设计、合成及活性
裴刚研究员/中科院上海生科院
Dawei Ma,* Shanghai Yu, Ben Li,Li Chen,Renhai Chen, Kunqian Yu, Linqi Zhang, Zhiwei Chen, Dafang Zhong,Zheng Gong, Renxiao Wang, Hualiang Jiang and Gang Pei, Synthesis and biological evaluation of 1,3,3,4-tetrasubstituted pyrrolidine CCR5 receptor antagonists. Discovery of a potent and orally bioavailable anti-HIV agent. ChemMedChem. 2007, 2, 187
共同承担863课题,申请国际专利两项,发现的高活性趋化因子受体CCR5拮抗剂具有很强的抑制HIV病毒对于正常细胞的感染的功能,目前作为治疗爱滋病的药物已完成一期临床实验。
2
冠状病毒蛋白水解酶的小分子抑制剂研究
饶子和教授/清华大学
Haitao Yang, Weiqing Xie, Xiaoyu Xue, Kailin Yang, Jing Ma, Wenxue Liang, Qi Zhao, Zhe Zhou, Duanqing Pei, John Ziebuhr, Rolf Hilgenfeld, Kwok Yung Yuen, Luet Wong, Guangxia Gao, Saijuan Chen, Zhu Chen, Dawei Ma*, Mark Bartlam & Zihe Rao*, Design of wide-spectrum inhibitors targeting coronavirus main proteases, PLoS Biology, 2005, 3, 1742
3
基质金属蛋白酶的小分子抑制剂研究
任进、叶其壮研究员/中科院上海药物所
Dawei Ma*, Yongwen Jiang, Fangping, Chen, Li-kun, Gong, Ke Ding, Yong Xu, Renxiao Wang, Aihua Ge, Jin Ren*, Jingya Li, Jia Li and Qizhuang Ye, Selective inhibition of matrix metalloproteinase isozymes and in vivo protection against emphysema by substituted g-keto carboxylic acids. J. Med. Chem. 2006, 49, 456
4
穿心莲内酯极其衍生物的结构-活性关系和抗炎机制研究
耿建国研究员/中科院上海生科院
Y. Xia, B. Ye, Y. Li, J. Wang, X. He, X. Lin, X. Yao, D. Ma, A. Slungaard, R. P. Hebbel, N. S. Key, J. Geng*, Andrographolide attenuates inflammation by inhibition of NF-kB activation through covalent modification of reduced cysteine 62 of p50, J. Immun. 2004,173, 4207
5
NUDT5水解ADP-ribose的机理
丁建平研究员/中科院上海生科院
Molecular mechanism of ADP-ribose hydrolysis by human NUDT5 from structural and kinetic studies. M. Zha, Q. Guo, Y. Zhang, B.Yu, Y. 
Ou, C. Zhong, J. Ding, J. Mol. Biol. 2008379, 568-578
6
中药活性成分的研究
江苏康缘药业
Dioseptemlosides A-H: cholestane and spirostane glycosides from the rhizomes of Dioscorea septemloba. X.-T. Liu, Z.-Z. Wang, W. Xiao, H.-W. Zhao, J. Hu, B. Yu, Phytochemistry 200869, 1411-1418. 
7
甾体皂甙的抗肿瘤机理
冯国培教授/香港中文大学
1.         Polyphyllin D induces mitochondrial fragmentation and acts directly on the mitochondria to induce apoptosis in drug-resistant HepG2 cells. R. C. Y. Ong, J. Lei, R. K. Y. Lee, J. Y. N. Cheung, K. P. Fung, C. Lin, H. P. Ho, B. Yu, M. Li, 
S. K. Kong, Cancer Lett. 2008261, 158-164.  
2.         Polyphillin D is a potent apoptosis inducer in drug-resistant HepG2 cells. J. Y.-N. Cheng, R. C. Y. Ong, Y.-K. Suen, V. Ooi, H. N.-C. Wong, T. C.-W. Mark, K. P. Fung, BYu, S. –K. Kong, Cancer Lett. 2005217, 203-211.
3.         Effects of Polyphyllin D, a steroidal saponin in Paris polyphylla, in growth inhibition of human breast cancer cells and in xenograft. M. –S. Lee, J. Y. –W. Chan, S. –K. Kong, B. Yu, V. E. –C. Ooi, H. N. –C. Wong, T. C. –W. Mak, K. –P. Fung, Cancer Biol Ther. 20054, 1248-54.
4.         Chemical and biological characterization of a polysaccharide biological response modifier from Aloe vera L. var. chinensis (Haw.) Berg. M. Y. K. Leung, C. Liu, L. F. Zhu, Y. Z. Hui, B. Yu, K. P. Fung, Glycobiology 200414, 501-510.
8
皂甙的合成
李英霞教授/中国海洋大学
1.         Synthesis of bidesmosidic dihydrodiosgenin saponins bearing a 3-O-beta-chacotriosyl moiety. Y. Zhang, Y. Li, S. Zhu, H. Guan, F. Lin, B. Yu, Carbohydr. Res. 2004339, 1753-1759.
2.         Synthesis of chlorogenin 6-O-acyl-3-O-b-chacotriosides and their antitumor activities. Y. Zhang, Y. Li, T. Guo, H. Guan, J. Shi, Q. Yu, B. Yu, Carbohydr. Res. 2005340, 1453-1459
9
皂甙的溶血活性
朱自严教授/上海血液中心
Exploration of the correlation between the structure, hemolytic activity, and cytotoxicity of steroid saponins. Y. Wang, Y. Zhang, 
Z. Zhu, S. Zhu, Y. Li, M. Li, B. Yu, Bioorg. Med. Chem. 200715, 2528-2532.
10
OSW1的抗肿瘤机理
吴家睿研究员/中科院上海生科院
Apoptosis induced by a new member of saponin family is mediated through caspase-8 dependent cleavage of Bcl-2. J. Zhu, L. Xiong, B. Yu, J. Wu, Mol. Pharm. 200568, 1831-8.
11
TNA的研究
Szostak/美国麻省总医院
1. Kinetic analysis of an efficient DNA-dependent TNA polymerase. A. Horhota, K. Zou, J. K. Ichida, B. Yu, L. W. McLaughlin, J. W. Szostak, J. C. Chaput, J. Am. Chem. Soc. 2005127, 7427-7434
2. Synthesis of a-L-threofuranosyl nucleoside triphosphates (tNTPs). K. Zou, A. Horhota, B. Yu, J. W. Szostak, L. W. McLaughlin, Org. Lett. 20057, 1485-1487. 
3.An in vitro selection system for TNA. J. K. Ichida, K. Zou, A. Horhota, B. Yu, L. W. McLaughlin, J. W. Szostak, J. Am. Chem. Soc. 2005127, 2802-2803.
12
Resveratrol的抗HIV机理研究
王来曦教授/美国马里兰大学
Resveratrol glucuronides as the metabolites of resveratrol in humans: Characterization, synthesis, and anti-HIV activity. L. X. Wang, A. Heredia, H. Song, Z. Zhang, B. Yu, C. Davis, R. Redfield,    J. Pharm. Sci. 200493, 2448-2457.
13
皂甙的质谱规律研究
刘志强研究员/中科院长春应化所
Mutiple-stage tandem mass spectrometry for differentiation of isomeric saponins. F. Song, M. Cui, Z. Liu, B. Yu, S. Liu, Rapid Commun. Mass Spectrum 200418, 2241-2248.
14
以天然产物生物合成为基础的新型生物农药的发现与创新
陶黎明教授/华东理工大学/上海南方农药中心
项目进行中...
15
多杀菌素的代谢工程研究
陈代杰教授/上海医药工业研究院
项目进行中...
16
阿维菌素和多拉菌素的代谢工程改造
浙江升华拜克公司
项目进行中...
17
天然产物类似物AA005的抗癌机制研究
吴家睿教授/中科院上海生科院
进行了长达数年的合作研究,证明了AA005具有诱导癌细胞坏死的特性,作用于线粒体并抑制氧化还原电子链的传递;同时,我们借助荧光标记化合物以及荧光共聚焦成像技术成功获得了AA005选择性进入癌细胞并在线粒体周围富集的实验证据;最后揭示了GluT4的运输机制是导致AA005选择性作用于一系列癌细胞的主要原因。
a)         Liu, H.-X.; Huang,G.-R.;Zhang, H.-M; Wu, J.-R.;* Yao, Z.-J.*Annonaceous Acetogenin Mimics Bearing a Terminal Lactam and Their Cytotoxicity against Cancer Cells, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007, 17, 3426-3430.
b)        Liu, H.-X.; Huang, G.-R.; Zhang, H.-M.; Jiang, S.; Wu, J.-R.;* Yao, Z.-J.* A Structure-Activity Guided Strategy for Fluorescent Labeling of Annonaceous Acetogenin Mimetics and Its Application in Cell Biology (Cover Story). ChemBioChem 2007, 8(2), 172-177.
c)        Huang, G., Jiang, S., Wu, Y.-L., Yao, Z.-J.*,and Wu, J.-R.* Induction of Cell death of gastric cancer cells by a modified compound of annonaceous acetogenin family. ChemBioChem 2003, 4(11), 1216-1221.
18
小分子天然化合物naringenin调控豆科植物生物固氮信号
洪国藩教授/中科院上海生科院
通过FRET实验证明了naringenin确实直接诱导了nod-A的基因表达;第一次通过荧光共聚焦实验观察到根瘤菌细胞的实态运动,并且发现naringenin的S异构体比其对映体诱导nod-A基因表达的速度快,但在8小时之后趋于一致的事实。
1)   Chen, L.; Li, F.-Q.; Hou, B.-H.; Hong, G.-F.;* Yao, Z.-J.* Site-Specific Fluorescent Labeling Approaches for Naringenin, an Essential Flavonone in Plant Nitrogen-Fixation Signaling Pathways. J. Org. Chem. 2008, 73(21), 8279-8285.
2)   Li, F.-Q.; Hou, B.-H.; Chen, Li.; Yao, Z.-J.; Hong, G.-F.* In vitro observation of the molecular interaction between NodD and its inducer naringenin as monitored by fluorescence resonance energy transfer. Acta Biochim. Biophys. Sin. 2008, 40(9), 783-789.
 
19
多氧霉素的生物合成途径中PolB蛋白的酶学机制研究
邓子新院士/上海交通大学
项目进行中...
20
乙肝病毒表面抗原蛋白PreS的结构测定与药物筛选
谢幼华教授/复旦大学
项目进行中...
21
影响水稻稻米口感品质的Waxy基因编码蛋白的结构测定、突变体设计以及后续的转基因操作
洪孟民院士、蔡秀玲博士/中科院上海植物生理生态研究所
项目进行中...
22
ESCRT系统蛋白-蛋白特异性相互作用、结构与动力学基础研究
徐兆辉教授/美国Michigan大学(Ann Arbor)医学院
项目进行中...
23
DNA硫修饰蛋白DndE结构与功能关系研究
邓子新院士/上海交通大学
项目进行中...
24
抗疟有机过氧化物研究
WatayaKim教授/Okayama University
1. Synthesis and in vitro Antimalarial Activity of Several Simple Analogues of Peroxyplakoric AcidHe-Hua Liu, Hong-Xia Jin, Qi Zhang, Yikang Wu,* Hye-Sook Kim and Yusuke Wataya*,Chinese Journal of Chemistry, 2005, 23, 14691473
2.Design, Synthesis and In Vitro Antimalarial Activity of SpiroperoxidesJin, H.-X.; Zhang, Q.; Kim, S.-H.; Wataya, Y.; Liu, H.-H.; Wu, Y.-K.*Tetrahedron 62 (2006) 7699–7711